Rest-AlphaSim

Submitted by cuihuifang on Wed, 07/04/2018 - 10:39

尊敬的老师：

您好！我是一名研究生，在The R-fMRI Network网站上看到您关于AlphaSim校正的教学视频，有几个问题想向您请教。

我做了AD和NC基于体素的双样本t检验，得到了AD-NC的nii脑图，现在想用REST做AlphaSim校正，REST中做AlphaSim时，

1)REST-AlphaSim中的P Threshold要设置成0.05还是按默认设置0.01呢？我是想得到p值小于0.05的cluster size的大小。

2)下面的mask文件是应该放我做完双样本t检验的AD-NC的脑图吗？我试了一下mask文件放我做完t检验的脑图，P Threshold按默认，

这样计算出来的AlphaSimtext和您在视频教学中放出来的的结果一模一样，第一个小于0.05的Alpha值是0.033，对应cluster size是19，

那我在slice-viewer中设置cluster size大于19就可以了吗？就是经过AlphaSim校正了吗？

puyunfashi

Thu, 07/05/2018 - 00:53

我们现在不建议使用AlphaSim做矫正了，请参阅https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/hbm.23843

您可尝试TFCE或者GRF矫正。

cuihuifang

Fri, 07/06/2018 - 12:38

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