各位老师，问一下局部degree centrality的计算问题

Submitted by wangkangcheng on Tue, 04/02/2013 - 12:30
 各位老师好，
    在BIOL PSYCHIATRY上看到一篇题为“Global prefrontal and fronto-amygdala dysconnectivity in bipolar I disorder with psychosis history"的文章。在文章中，首先作者在前额内做每一个voxel和其他voxels的相关，然后把相关值转化成了Z值，再计算出来平均值的map。

请问老师，在rest1.8中，选择degree centrality，然后在Mask下面的Input Mask file处选择上前额的mask就可以了吗？
谢谢老师 

Forums:

YAN Chao-Gan

Tue, 04/09/2013 - 20:07

Tomasi在以前的一篇文章有lFCD的算法，比较复杂一些。

Tomasi, D., Volkow, N.D., 2010. Functional connectivity density mapping. Proc Natl Acad Sci U S A 107, 9885-9890.

如果给定前额叶MASK，将计算在该区域内的degree centrality.

Lei.Gao

Tue, 04/09/2013 - 21:07

 严老师：
        您好！看到这个帖子，突然有个问题，在一个简单的网络里，比如我想做一个20 (rois)的功能连接矩阵，做好了之后得到一个20×20的相关矩阵，我想看每个节点与其他节点(399个节点？)的degree centrality，该用什么样的代码运行呢？这样基于ROI的度值分析可行吗？非常感谢严老师在百忙之中的解答，谢谢！

banyu

Wed, 04/10/2013 - 07:39

您好：
我也有同样的问题，坐等各位老师的回答，哈哈。

YAN Chao-Gan

Thu, 04/11/2013 - 21:20

这个很简单，就是对于20*20的矩阵，取行（或列）的和即可。如果是binarized　degree，先二值化再取和。

对了，提前先把对角线元素置0　。