求助VMHC的一个问题

Submitted by liufeng on Thu, 09/13/2012 - 16:02

大家好，最近我打算用rest试着跑VMHC，出现以下问题：

我直接打开rest的，然后输入数据目录，提示没数据。
我不知道做VHMC需要哪步的数据，我试过这些目录的数据，都提示no data：
FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFiltered
FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFilteredCovremoved

应该选择哪一步的数据呢？

谢谢

Forums:

YAN Chao-Gan

Fri, 09/14/2012 - 16:49

VMHC原理与功能连接(seed based correlation)差不多。所以两者应该用相似的预处理。即FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFilteredCovremoved

如果你是选择上面的总文件夹的话，需要点右键“Add recursively all sub-folders of a directory”来添加。

Chen0075

Fri, 02/22/2013 - 16:33

 您好！
我对VMHC也感兴趣，读了几篇文献发现都是基于FSL/Alfani做的，我们的新版Deparsf是否能够全程跑完。
1）跑到FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFilteredCovremoved，是否表示预处理完成了。接下来再选择“Normalize  to symmetric template” 和“VMHC”即可？
2）新版里“Normalize derivative” 和“smooth derivative” 是用来干什么的，要选择吗？
3）文献里VMHC的统计比较似乎也和我们平时用的不一样，能够用rest里面的FDR/Montcarlo矫正吗
谢谢！


YAN Chao-Gan

Sun, 02/24/2013 - 08:49

Hi,

1. 预处理步骤是完成了，这是一种比较常见的方式，当然争议还是存在。如果你是用basic edition处理的，然后再advanced edition做normalize to symmetric template，不一定能正确地找到文件，但你可以试试。

2. normalize derivative是在原始空间计算之后，把计算出来的指标（如ALFF）配到MNI空间。smooth同理。

3. 我认为在一侧MASK里面是可以的。