请教如何计算各脑区的体积和密度信息

Submitted by 06170323 on Mon, 05/30/2011 - 11:21

论坛版主：
你们好！
不好意思，打扰你们了，我想请教各位一个如何提取各个脑区的体积信息。结构的数据我已经有了，用VBM处理过数据，但我感兴趣的是每个脑区体积的信息，而不是总体灰质或白质的情况，比如我想提取AAL模板中第58个脑区的体积数据

，不知道有没能软件能实现这个功能。
谢谢！！

Forums:

YAN Chao-Gan

Mon, 05/30/2011 - 13:50

REST->Utilities->Extract ROI signals。
视频里面有介绍。

06170323

Tue, 05/31/2011 - 01:43

谢谢你的回答
我还有个疑问，rest中Extract ROI signals功能是根据你MASK里的体素按均值提取出来的吧。但我如果要提取第52个脑区的体积时，我提取的应该不是这个脑区MASK里体素的一个均值，而是一个第52个脑区里所有体素的一个求和吧，如何解决这一问题呢？
打扰了，抱歉！

06170323

Tue, 05/31/2011 - 01:44

谢谢你的回答
我还有个疑问，rest中Extract ROI signals功能是根据你MASK里的体素按均值提取出来的吧。但我如果要提取第52个脑区的体积时，我提取的应该不是这个脑区MASK里体素的一个均值，而是一个第52个脑区里所有体素的一个求和吧，如何解决这一问题呢？
打扰了，抱歉！

YAN Chao-Gan

Tue, 05/31/2011 - 15:53

鉴于你的需要，你应该是用REST Extract ROI Signals中"Multiple label values in a single mask"选项，才能一下提取多个AAL脑区的值。
如果是这种情况，打开rest_ExtractROITC_MultiValues.m，将第53行从
theROITimeCourses(t) =mean(theTimePoint);
改为
theROITimeCourses(t) =sum(theTimePoint);

即可。

06170323

Wed, 06/01/2011 - 00:36

非常感谢！！REST新加的功能Multiple label values in a single mask非常漂亮！