关于rest图像中病灶的处理

Submitted by Louise on Sat, 03/30/2013 - 10:00

老师好！
最近在处理病人的rest图像，碰到这样一些问题。1、有的病人图像有病灶。2、有的病人有时会出现脑萎缩，脑室也会较大。3、有的病人有脑外伤，就是有一块图像会凸出来。碰到这样的图像，您一般会如何处理，如果都去掉，被试就会少很多。关于病灶的处理，之前在您的视频中好像有讲画一个mask，不知道这个该如何具体操作？接触FMRI不久，希望老师指点。多谢！

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YAN Chao-Gan

Tue, 04/09/2013 - 19:41

这个问题不是特别好处理，你可以参考一下脑损伤研究的文献？印象中SPM有一个插件专门做脑损伤的数据处理。

也有一种做法是采用AFNI手动配准（虽然精度可能不是太高）。

Louise

Thu, 04/11/2013 - 14:57

多谢严老师指点，是要看一下脑损伤的文献。还有就是关于SPM的插件，不知严老师能否帮忙看一下具体是那个插件啊，我之前没有注意过~~~多谢啊

YAN Chao-Gan

Thu, 04/11/2013 - 21:29

参考一下：http://www.mccauslandcenter.sc.edu/CRNL/tools/i3m

Louise

Sat, 04/13/2013 - 04:00

多谢多谢！！

ZangYF

Sat, 04/13/2013 - 08:57

 病变如何处理，的确是比较复杂。(1)如果是明确的比较大的病灶，空间配准就是一个问题。解决方案包括手工画出病变范围，然后采用自动配准，也可以考虑采用AFNI中的手工配准方法（如果病变没有明确影响到那些标志点的话）。(2)如果仅仅是脑室较大，可以采用自动配准方法，但配准之后需要检查一下每个人的配准的效果。并且voxel-wise的组间比较之后，如果发现脑室附近的异常，需要慎重，最好再仔细检查一下这个异常的部位在每个被试的具体位置。(3)脑外伤或手术后颅骨缺损导致脑膨出，恐怕手工画之后的自动配准也不能解决问题，最好采用人工配准到TT模板。

 
无论哪种情况，在明显的结构病变附近的功能异常，解释都要慎重，因为这种明显的结构异常本身可能就会导致功能异常。

Louise

Sun, 04/14/2013 - 13:44

非常非常感谢臧老师详细的答复！臧老师，在手工画出病变范围的时候，因为每层病灶的大小是不一样的，是在每层上进行处理吗？另外，您在做研究的时候，对病灶都进行处理吗，可不可以说如果病灶不是很大，比如2cm左右或者一个范围内，可以不进行处理，有没有这样一个标准，不知这样是否可行？另外一个问题就是，脑室较大的病人，因为他们的TI图像也可能不正常，配准的时候是宜采用EPI配准吗？

ZangYF

Sun, 04/14/2013 - 22:15

 我没有处理过这样的问题，也没听说过有关病灶大小的标准。如果手画的话，肯定要画多个层面（由于3D结构像是高分辨率，未必需要每层都画）。如果单纯脑室大而没有非常明显的病灶（如AD），采用结构像或EPI进行自动配准是可以的。

Louise

Mon, 04/15/2013 - 01:36

嗯，明白了，非常感谢臧老师的指导!祝好~~