请教关于DPABISurf的一些问题

Submitted by 于雪雪 on Sun, 04/12/2020 - 10:45
尊敬的老师们，您好！
        我想问下我已经在freesurfer中处理了皮质重建，可以用这个在freesurfer中处理了的数据在dpabisurfer进行后续数据处理吗？还有我想问下dpabisurf中的mask中的SurfLH,SurfRH、Volume是不是一般选默认的模板，可以为空吗？若为空的话，会有什么后果吗？期待老师的回复，万分感谢！
 
 
 
 
 

Forums:

YAN Chao-Gan

Sat, 04/18/2020 - 00:50

1. 不能。

2. 应该不能，你可以尝试一下。

于雪雪

Mon, 04/20/2020 - 16:13

谢谢严老师您的回复！
老师，我有一批已经用fmriprep处理好的数据，我想问下这组数据之后的步骤可不可以用dpabisurf进行处理呀？那个sub-Sub001_task-rest_space-MNI152NLin2009cAsym_boldref.nii，sub-Sub001_task-rest_space-MNI152NLin2009cAsym_desc-aparcaseg_dseg.nii，sub-Sub001_task-rest_space-MNI152NLin2009cAsym_desc-aseg_dseg.nii分别是什么文件呀，是不是所有被试的这些文件都是相同的，因为我正在试着用已经fmriprep处理好的数据进行后续的步骤，对比了下文件，发现我的数据里面没有这些，导致在organize fmriprep那里出错了。问题有点多，麻烦老师了，万分期待老师的回复！

YAN Chao-Gan

Thu, 04/23/2020 - 00:00

你可以注释掉复制这些文件。Anyway，我还是建议你重跑一遍。

于雪雪

Thu, 04/23/2020 - 04:27

谢谢严老师您的回复！

我想问下CompCor与nuisance covariates regression是一样的吗，在freeprep中做了CompCor，后续步骤中还需要做nuisance covariates regression吗？万分感谢老师您的回复！

YAN Chao-Gan

Fri, 04/24/2020 - 08:55

通常做CompCor还要在nuisance covarites regression里去掉头动参数。如Friston 24